Указом Императора Александра I Правительствующему Сенату от 23 февраля 1804 года Севастополю был придан статус "главного военного порта", в который был запрещен вход "купеческим" кораблям. Исключение было сделано только для кораблей, терпящих бедствие или нуждающихся в починке, по окончании которой им предписывалось немедленно оставлять порт.
Севастополь был объявлен главным военным портом Черноморского флота вместо Николаева. Город, выведенный из состава Таврической губернии, становился самостоятельной административной единицей. Правда, официально назывался он не Севастополем, а Ахтиаром. Дело в том, что после смерти Екатерины II, ее сын император Павел I отменил многие указы своей матери. В том числе переименовал некоторые города Крыма. Только в 1826 году уже император Николай I распорядился: «Город не именовать впредь Ахтиаром, но всегда Севастополем». В начале 19 века в Севастополе проживало 10 тысяч человек, спустя три десятилетия население утроилось и составляло около 30 тысяч жителей. Самым крупным предприятием города было Адмиралтейство. С 1810 по 1827 год здесь построили 17 и отремонтировали 14 военных судов. Со стапелей Адмиралтейства в 1820 году сошел знаменитый бриг "Меркурий". Потребности города и флота обеспечивали и маленькие заводики: 3 кожевенных, 3 свечных, 2 кузницы, мельница и т. п. К1827 году было построено около 2 тысяч домов и 3 церкви. Самым высоким сооружением в центральной части города была Минная башня высотой около 18 метров. Она служила входом в Минное адмиралтейство. На башне были установлены городские часы.