Когда грянула война, десятки тысяч советских немцев оказались на службе в Красной Армии и воевали на многих фронтах. Тяжелейшая участь ожидала основную массу немецкого населения страны. 4 июля 1941 года была издана директива НКВД и НКГБ СССР "О мероприятиях по выселению социально опасных элементов с территорий объявленных на военном положении". Эта директива подразумевала и выселение немцев из Крыма. Когда в августе началось формирование 51-й армии, в директиве 00931 Ставки Верховного Главнокомандования от 14 августа 1941 г. давалось предписание: "Очистить немедленно территорию полуострова от местных жителей немцев и других антисоветских элементов".