Федеральное государственное бюджетное учреждение науки «Всероссийский национальный научно-исследовательский институт виноградарства и виноделия «Магарач» РАН» создан 15 декабря 2015 г. на основании распоряжения Правительства Российской Федерации от 7 сентября 2015 г. № 1743-р и является преемником основанного в 1828 г. по распоряжению новороссийского генерал-губернатора князя М. С. Воронцова при Никитском ботаническом саде опытного виноградовинодельческого заведения «Магарач».

В 1840 г. он был выделен в опытное виноградовинодельческое заведение «Магарач».